Para cumplir con los objetivos propuestos, el Instituto cuenta con dos Estaciones Experimentales:
Estación Experimental Santa Rosa
Es la sede principal del Instituto. Está ubicada a 1936 msnm, en una zona de vida de bosque húmedo premontano, en el sector Santa Rosa, vía La Hechicera municipio Libertador, estado Mérida.
Estación Experimental San Juan
Está ubicada a 1050 msnm en una zona de vida de bosque seco premontano, en San Juan de Lagunillas, municipio Sucre, estado Mérida.
Como apoyo a la investigación se cuenta con dos estaciones climatológicas, una en cada estación experimental; con laboratorios de Suelos y Química Agrícola, de Fitopatología, de Entomología, de Ecofisiología de Cultivos; los cuales prestan además un servicio de extensión a la comunidad agropecuaria alto andina.